ما اورده تقرير دائرة المحاسبات من تجاوزات صلب بعضها، كما اشارت الوزارة الى أن أعمال تقرير دائرة المحاسبات السنوي غطى فترة زمنية سبقت تسلم سليم خلبوس لمهمامه على رأس الوزارة.
يشار الى أن تقرير دائرة المحسابات اورد ان وزارة التعليم العالي والبحث العلمي لم تراقب الامتحانات ببعض مؤسسات التعليم العالي الخاص وتجاوز مؤسسات أخرى لطاقة الإستيعاب القصوى المحددة من قبل الوزارة بـ 4 أضعاف، وأظهر تسجيل 400 طالب من قبل 7 مؤسسات خاصة في 16 شهادة غير مؤهلة دون أن تتخذ الوزارة الإجراءات القانونية اللازمة ضد المؤسسات المخالفة.