وتعرض المسجد في السنوات الماضية للإهمال لدرجة أنه استخدم كمصنع للصابون ومجزر وحصن. جدل مسجد "شنودة" في مصر يتواصل.. قرار رسمي بتغيير الاسم . وبُني مسجد الظاهر بيبرس عام 1268 في عصر المماليك البحرية، ويمتد على مساحة ثلاثة أفدنة في منطقة الظاهر بحي الوايلي في شمال وسط العاصمة المصرية، مما يجعله ثالث أكبر مسجد في مصر.
وقال طارق محمد البحيري المشرف على أعمال الترميم، إن المسجد خضع لعملية ترميم هندسية وكيميائية لإعادته إلى حالته الأصلية.
والظاهر بيبرس الذي يحمل المسجد اسمه يمثل البداية الفعلية لحكم المماليك في مصر الذي امتد لثلاثة قرون حتى انتهى بدخول العثمانيين مصر عام 1517.